Gblocks 0.91b Results

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Number of sequences: 13
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New number of positions: 300 (selected positions are underlined in blue)

                         10        20        30        40        50        60
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ------------ATTTAT---TTATTTTTAAGTATGTCTACAATAATTAGTATTAGATTA
PAQ              ------------ATACTA---ATAAATTTTATTGGGATGATTATTTTCATAATTTTAATA
BAU              ------------ATATCA---TGAATACTTTTAGTTATACTTCTACTCTCAATTTCAATA
SVI              ATGAACTTTTTAATAAAA---TTAATAGTTCTATTTTCTTCATTTATAAGCTTTCTAATC
FOC              ------------ATTAAA---TTAATTATAATAAGTTCTATTATTATTTCTTCAATCATC
FGR_AP           ATA---------ACAACTCTAATTTTTATGGGCCTAGCTGTATTTAATTCAATTTGCTTA
FGR_VL           ------------ATAGCTTTTTTATTTATCCTGCTAACTATTAATAATTCTATTTGATTA
CTE              ---------------------ATAATTTTATTGCTCTCTTTTATAATCAGCAACTTATAC
CAN              ATT---CTTGATATTAAA---TTAATATTTATCTCCTCAGTTTTTAGTAGTATAATAATT
OOR              ATT------------------ATTTTTTTAACGTTATCTGTGATTGTAAGAACTTTATTT
OVI              ------------ATTATA---TTATTTATAATATTATCTGCAACTATTAGTATAACTTTA
TBI              ------------ATAAAATTTATAATTATTTTTACATCCTCAATATTAAGAAATATATTC
GHO              ATTTCTTATGGTATAAAA---ATTTTATATTTTTCTACTATTATTATAGCTTCAATTTTT
                                         ####################################


                         70        80        90       100       110       120
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ATAATAGTTTCACACCCAATTGCAATCCTATCATTAATTTTAATACAAACTATAAACTTA
PAQ              ATGAGTTCACGCACACCTATTGTAATAATAGGTATTGTTCTGAGTCAATCCATCTTAACT
BAU              TTGTCTTCTTCGTCTCCTATTGTGTTTATTATTTTAATTATCACTCAAACTTTATGTATT
SVI              ATAAAGACAAATAACCCTATAATATTTACAGTAGTAATCTTACTACAAGCCTTGTTTCTA
FOC              ATAATTAATGTCCACCCTATAACATTAATAATTATAATTTTAACCCAAGTATTACTAATT
FGR_AP           TGCTTAGTAAACGCCCCTATTTTAATGTTAGCTATTATTTTAATTCAAGCCCTGATAATT
FGR_VL           TGTTTTACTAATACCCCTATTCTAATAATAATAATCATTTTATTTCAAGCTATCCTAATT
CTE              TTAATTAGAAGACATCCAGTGATATTAATAATATTAATCCTAATCCAAGCAACACTAATC
CAN              ATATCAAGCTCACATCCGGTAGCTATCATAGCATACATTCTCATACAAACAATTATTGTA
OOR              TACCAAGCTAACCACCCTATCACTGCTATATTAATTATTACATGTCAAACATCACTCCTA
OVI              ATAATAATATCTCACCCCATTTCTATTCTAGTTCTTATTTTAATTCAAACAATAAATATA
TBI              TTCACTATTAATCACCCTATTGCTCTAGTCATAATAGTACTAACCCAAACCTCCATTTTA
GHO              TTAACAAATTCTAGCCCACTAATTATAGTATTAATTATTGGGCTACAAACTCTGATTATA
                 ############################################################


                        130       140       150       160       170       180
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              TGTTTTCTAATTTGAATGTTAATTAAAATTAATTGACTCCCCTACATTCTGTTCCTAATC
PAQ              GCATTATATATCAGATTAAATGCACCCAATTCATGGCTATCTTTTGTATTATTTTTAGTT
BAU              TGTTTGTCTATAAAGCTACTCTCTTATTCCCCCATTTTTTCAATAATCCTTTTTTTAATT
SVI              TGTATAATAATTTGCTTTTCAATAAATACGTCGTGGTTTTCCTATATTCTCTTTCTTATC
FOC              TGCTTAATGAATTGAGGGGTAAATAAAATAAGATGATTTTCCTATGTTCTATTTTTAATT
FGR_AP           TGTTTGATAGTAAAAAGATTTTCCAGAATTTCCTGATATTCTTTTATCTTATTTCTTGTA
FGR_VL           TGCTTGACTGTAAAATCAATAATTAGAATTTCATGATTTTCATTTATCCTATTTTTAGTA
CTE              TGTTTAATCTCCTGACTTTACTTAAAATTTAGCTGATTTGCCTATATTTTATTTTTAGTA
CAN              TGTTTAATAGCTTGGATATTTTTAAAAACAAGTTGATTTTCATTTATTTTATTTTTAGTA
OOR              TGCTGTTTAATCTTTTTTATCCTTTCCATAAACTGATTCTCTATAATACTATCTCTTATC
OVI              TGTCTTATTATTTGAGTAAAAATAAGAACTAGATGATTATCCTACATTTTATTCCTAATT
TBI              TGTATATTAATCTTTATAATAACCTCAACTGCTTGATTTTCATTTATATTGTTTTTAATT
GHO              TGCTTATCTATTGTTTTTATTATAAATACATCTTGATTCGCATTTATTCTATTTTTAGTA
                 ############################################################


                        190       200       210       220       230       240
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              TTTTTAGGAGGATTAATAGTTTTATTTATATACGTTACTAGTTTAGCTTCTAACGAAAAA
PAQ              TTTTCGGGGGGACTAATAATCTTATTTGTCTATATTACTAGACTTGCATCAAGAGAAGTA
BAU              TTTATTGGAGGCATAATGGTCCTATTTTCGTATATTGTAAGACTTACACCTAATAATTCT
SVI              TTTTTAGGGGGACTAATGATTATTTTTTCATATGTTTGCAGGTTAGCCTCTAATGAAAGA
FOC              TTTTTGGGGGGATTAATGGTACTTTTTATTTATATTACAAGATTAGCTTCTAATGAAAAA
FGR_AP           TTTGTTGGAGGACTTATAATTCTATTTATTTATATTGTAAGACTAGCTTCAAATAATAAT
FGR_VL           TTTATCGGAGGATTAATGATCTTATTTATTTATATTGTAAGACTAGCTTCTAATAGAAAT
CTE              TTCCTTGGGGGGTTAATAGTACTGTTTATTTACATCACTAGCTTAGCTTCAAATGAATTA
CAN              TTTTTAGGGGGGCTTATAGTCCTATTTATTTATATTACTAGATTAGCATCTAATGAAATA
OOR              TTTATAGGAGGTTTAATAATTTTGTTTGTCTATATTTCTAGTCTAGCTTCTAACGAAAAA
OVI              TTTTTGGGGGGGCTAATAGTTTTATTTATATATATTACTAGATTAGCTTCAAATGAAAAA
TBI              ATAATAGGAGGTATCATAGTATTATTTATCTATATTGCAAGTCTAGCATCAAATGAAAAA
GHO              TTTATAGGAGGACTAATAGTTTTATTTGTTTATATTACCAGATTAGCTTCTAATGAATTA
                 ############################################################


                        250       260       270       280       290       300
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              TTTGAAATAAATATTGAAGAAATAAAGACAACCGCAGGAATAGGAAGAACTGTAATATTT
PAQ              CTAACAAGCCCTGTTAATTTATCTTTTATTGAAATTATATTAAGTAGTCTAGCTTTTATA
BAU              GTTATAACTCCTCTACAACTTTTACTATCAAATAAAATAATTTTACTTCTCAGATTTATT
SVI              ATTAATATTCAGATTCAGCCGGTATCAATTTCTTCC---ATAGCTCTAGTGAGAACTCTA
FOC              TTCAATTTTAACTTAAATTTAGTAATAACAAATATTATATGAGTAATTATTGCAACAGTG
FGR_AP           CTTACAATTTCAATAAACAAACCTCTTATTTTTACG------TTATTTAGTTCTTTAATA
FGR_VL           TTAACTATCTCACATAATAAATTCTTATTAACCTCT---TTAATTATTATTTCCATCTTT
CTE              ATAAAGTATGACTTAAGTTCCTTTACAATGGCAGCA------------GTAATTTTATTT
CAN              ATTAAATTAAACTTAAATAATATGCTTTTAACCCTT---TTTACTACAGTGGGGGTAGTA
OOR              TTTAAACTTTCTTTCAAAACCATAACTTTACCAATA---ATCTCCTTAGTTACTTATTTG
OVI              TTTGAATTAAATGTAAATTCATCCTACAATATAGTT---GTAGGAATAAGATTTTTTTTT
TBI              TTTCACTTTAAATATAAAACAGCTATACTTCTACTA---ATACCCATAATTATTGTCATA
GHO              TTTCATTTCTCTAGTAAAAATAATAACTTT---------ATTTTATACACAAGTATATTT
                 ###############                                             


                        310       320       330       340       350       360
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              TTTTCTTTACTAATTGTCTATTTTAAT------------------TTTAATATGCAACCC
PAQ              GTTATTTCACAC---AGCTTACTTTCA------------------GACAACTTTATTGAT
BAU              CTTTTAATAATAAGCATTTTTTTTAGACTTAAAATTAATTTAATTGAAACTAATACTATG
SVI              ---------------ATTCTTTTAAATGGA---------------AGGGAAATTAACCTA
FOC              TTATTTTTTATA---ATAATAAAAAAT------------------GAACAATATAATTTA
FGR_AP           ATTTTTAGCCTTAGTGTTATAATAACATCAAAA------------AATAACACCCTTAGA
FGR_VL           ATCTTTTCTTGA---ATAATTTTAAACGAAAAA------------AACTTTAATTTATCT
CTE              ATAGTAAGTACAATAGTCTTCTTTAACTGG---------------AATGGATGCTCATTA
CAN              ATAATTATAATA---AGATACTTAAAC------------------CACCAAATAGAACTA
OOR              AGTTTAACCTTA------CTATTTAAA------------------GAAAATTATATATTT
OVI              ATTATTACTTTTACAACCCTGTTTTTT------------------GATAAGATCAAAACA
TBI              TTTATTATATTA---GTACTTTATAAT------------------TCTCAAGACTACTTA
GHO              AGTTTATCTTTATTAATAATCTTAACTTTTAAA------------GAAAATCAAAATAAC
                                                                             


                        370       380       390       400       410       420
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              CCCTTAAATATTTTA------TCCCAACAAAATAGAATA---ATTTTTAGAAGCCCTGTA
PAQ              AAAGTAGTCAACTTAAACAAAACTCAAACATTCTACAAA---ATATTTTACTTAGAGAAT
BAU              AATAAACCATTTATTAATATTTTAACTTCAATTTTTAAT---GTCTACTCACAT---TCT
SVI              ---TCCATGCTAAATGACAGTGTACAAACAATCTTCAAG---ATAATAAGAAAGCTTATA
FOC              ---TTAAGATGATTTATTAGATTAAAATCTTTTAACGAA---ATATACTCATTTAGAATA
FGR_AP           GGCCCTACTCTAATAGAAACTAAACTATGACTTTTTAAA---ATATATTCTATAACATCT
FGR_VL           AAAACAGTCTTTCTTGAAGTTAACCAATGACTCTTTAAG---ATATACTCTAATTTATCC
CTE              GATCTTATAATATTTAATAAATCTATTAATTACTTTTCAGGAATATATTCTCTTCCTACT
CAN              AAAATAGATTTACTAAACCAAACTAAAACATTTTTTAAT---ATATATTCTTTTGAATCT
OOR              AATAACGAGTCAGAAATTTTTGTTTATAATATTTTTTTT---ATATATGCACAAAATATC
OVI              ---GCTGAAAATATTACAATTATAAAACAAGCCAGAATA---TTATTTTCTACACCAATG
TBI              ---TTTAATTATATTGAATTCAAAACTCTAATTTATTTA---ATTTATTCTCATTACATC
GHO              AAACTATTAAATTTAAATATTAAAGAAATAATCTTTAAA---GTATACTCTAACAGAAGA
                                                                             


                        430       440       450       460       470       480
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ACATACTTAACATTGATTATTATAAGCTTTCTACTAATTACCCTGGTAGTAGCTGTAAAA
PAQ              ATAAACCCTATATTAACATTAATTATTTACCTTTTAGTATGCTTATTAATTGTTGTTAGA
BAU              ATATGAATTGTATTTATGATGTTTTTTCTTCTCTTACTCACCTTAATTATTGTAGTCTTT
SVI              GTAACGCCGTCAATTGTATCTATATTTTATCTATTAATTACACTAATTGTAATTGTAAAG
FOC              TCCCTAATCTCTTTAATAACAATAATTTATTTATTTTTAACTCTGATTGTTGTAGTGAAA
FGR_AP           CTGCCTACTATTTTAATGGTAATACTATATCTGTTACTAACCTTAATAATCACAGTCAGA
FGR_VL           GCCCACACTATTACTTTAGTTATATTGTATCTTCTTCTCACCTTACTTATCACTGTTAGC
CTE              TTTACTTTAATTGGTTTAACTATAATTTACTTGCTTTTTACTCTTATTGTAGTAGTAAAA
CAN              TTAACTATAACCGGGCTAGCTATAATTTATCTTCTTTTAACATTAATCGTAGTAGTAAAA
OOR              TTTATCCCTGTATTTTTAACTATAAATTATCTTCTTTTAGTTCTAGTAATTTCTGTAAAC
OVI              TTTACAATTACTTTTTTAATTATAACTTATTTATTAATAACTTTAATTATCGCAGTAAAA
TBI              TTATACCCAACATTAATCTCCATACTATATTTGTTGTTAACCTTAATTATTACAGTAGAC
GHO              GTGATATTAACTTCTATGACTATAATTTATTTGCTACTAGTCCTAATTGTAGCTGTTTCT
                                   ##########################################


                        490       500       510       520       530       540
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ATTACAACAAAATTTGAAGGACCTTTACGCAGTATTTTTCATAAA---------------
PAQ              CTAGTGAAAAAAGACCAAGGAACTCTACGCACGACTACCCGT------------------
BAU              TGTGTACTTACAAATAGAGGACCAATACGTTCTTTAACTATGAAGTTA---------AAT
SVI              ATTTCATTTAAAAAAATGGGGTCCTTACGTTCAAGGAAAAAGTATGATAATTCGAAAAAG
FOC              ACAGCCTCTAAATATGAAGGCCCCCTACGAAATATAATTTTT------------------
FGR_AP           TTAGTTTTAAAAAAAAGAGGACCATTACGTAGAATTATTTTAAAT---------------
FGR_VL           ATTATCTTAAAAAAAAGAGGTCCGTTACGAAGAATTTATTTAAATAAA---------CAA
CTE              GTATCTAATAAGTTTGACGCCCCCATTAAAAATATTTTTATT------------------
CAN              ATTTCTAATAAGTTTAATGCCCCTATTAAAAATTTAATTTTTGAG---------------
OOR              ATTATTAAACTATACGACGCCCCGATACGATCCGGAACAGTT------------------
OVI              ATTACTTCAAAATTTGAAGGCCCTTTACGTAGTGTAATTAAAAAA---------------
TBI              TTAGTAAAATTATATGAAGCTCCTATCCGATCCTTAACC---------------------
GHO              ATTACATCTTTATATGAAGGACCCATTCGAAGAACTACTAAAATT---------------
                 ###########################                                 






Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 7 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 11 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 4 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: None
Flank positions of the 2 selected block(s)
Flanks: [25  255]  [439  507]  

New number of positions in nad6.fas_checked.fasta.aligned.fastafasta:  300  (55% of the original 540 positions)