Gblocks 0.91b Results

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Number of sequences: 13
Alignment assumed to be: Codons
New number of positions: 618 (selected positions are underlined in blue)

                         10        20        30        40        50        60
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ---ATGATAACAAATTTATTCTCCGTATTTGACCCATCCGCTAACTTTAATTTGCCTTTA
PAQ              ---ATGATAACAAACTTATTTTCAAGATTTGACCCAAACTCTACTTACTTTATATTGAGT
BAU              ---ATGATAACTAATCTTTTTTCCAGATTTGATCCTTGCTCATCAACCTATATGTTCTCA
SVI              ---ATGATAACTAATCTTTTCTCGATTTTTGACCCCTCAACTTCAATAGGAACTTCATTA
FOC              ATGATAATAACTAATTTATTTTCAGTTTTTGACCCCTCTTCAACTTTTAATATATCGATA
FGR_AP           ---ATGATAACAAGCCTTTTCTCAAGTTTCGACCCATGCTCATCCTCTAATTTATTTAAT
FGR_VL           ---ATGATAACAAGTCTATTTTCAAGCTTTGACCCATGTTCATCAAACAATTTATTTAAT
CTE              ------ATAACAAATTTATTCTCAGCATTTGACCCCTCTTCATCATTTAGTTTTCCCTTA
CAN              ---ATGATAACTAATTTATTTTCGGTTTTTGACCCATCTTCTTCTTTAAGAATACCTATA
OOR              ------ATAACAAATCTATTCAGAGTATTCGACCCAACCTCATCTTTTCAAATTAGTTCT
OVI              ---ATGATAACTAATTTATTTTCTGTGTTTGACCCCGCCGCAAACTTTAATTTACCCTTA
TBI              ---ATGATAACTAATTTATTTAGAATCTTCGATCCAGCCTCATCAATTCAATCATCCTCC
GHO              ---ATGATAACAAATTTATTTTCTAGCTTTGATCCTTCTTCATCAACCCCACTACTTTAT
                       ######################################################


                         70        80        90       100       110       120
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              AACTGAGTCAGTGGATATTTAGTAATCATTATGGTTATTCCTACTTTCTGAGCTATTTCA
PAQ              AACTGATTAAGTACTTTCTGTCTATTTTTCCTTATGCCCAGCTCTTTTTGACTTATAAAA
BAU              AACTGATTTAGTTCTTTTATCTTTATTTCTATCGTACCTAGAATCTTTTGATTTTCTAAA
SVI              AATTGATCTTCTATATTTATTATTCTATTGATATTATTTCCTTGCTACTGAGCAATTCCA
FOC              AATTGATTAAGAAGTTTAATTATAATGTTAATTTTATCGTCAATATTTTGAGTTATCCCT
FGR_AP           AATTGATTAAGAACTTTAATATTTATTTTAATTTTCCCATCAACATACTGAATAATCAAT
FGR_VL           AATTGATTAAGAACTTTAACATTTATTATTATTCTTCCATCAACTTATTGAATGAATAAT
CTE              AATTGAATTAGTTCATTAATTTTCATTTTATGTCTTATTCCAATTTTTTGAATTATCCCT
CAN              AATTGAGTAAGAGCCCTAATCTTTATTTTAGTAGTTATTCCCACATTTTGAGTAACCCCT
OOR              AATTGATTAGGTTCTTTCCTTATTTTATTCCTTATCCCGCCATCCTTTTGAATTTTAAAG
OVI              AATTGATTAAGAGGTAACTTATTTTTACTAATAATCATTCCTACTTATTGAGTAGTAGCA
TBI              AATTGATCTAGAACTATTATTATTATATTAATAATGACTCCTATATTCTGATTAATTCCA
GHO              AATTGACTAGGCTTATTTGTTCTAATAATATTAATTACTCGTATAAGCTGATTGATCCCT
                 ############################################################


                        130       140       150       160       170       180
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              TCTAAAATAAATAAAAGAATAAATTTAATTACAAACAAATTATATGGAGAATTTAAAACT
PAQ              GGGCGTACGGCTGTAGCCTTTTTTCAACCAGTTAGCATTTTATTTAACGAATTTAAATCA
BAU              AGACGAAGAAATTTGCTTTTTACAATAGTCCTCAACCCTTTATTTAATGAACTAAAAGTT
SVI              AGAAATATTAATATATTCTTTTCTAATATTGTAAGAGTATTGCATAAAGAAATTAAAATT
FOC              AGAAAAAATTTATACATATTAAAATTTGTTTCATTAAAACTTCATAGTGAATTTAAAACA
FGR_AP           AACCGATTCTCTATCCTAATAAAAAACATTATTAATACCCTTCACAATGAATTCAAACTT
FGR_VL           AACCGACTATCAGTACTACTTAAAAATATCAGAATAACTCTTCACAATGAATTTAAACTT
CTE              ACTAAGCCTTTCATTCTCATTAATATAGCAGTTTCTAAACTTCATTCAGAGTTTAAAACT
CAN              ACCAAAGCTGCTACTGGGTTAAACGCCATGTCAGAAAAATTACACTACGAATTTAAGACC
OOR              AATCGTTTATTTTATCTTTTTCATAAAATTTTTTCTTCACTTTTTAACGAAATAAAAATC
OVI              TCAAAAATAAATAAAACTTTGGTTATAATTACACAAAAACTACACTCAGAATTTAAAACT
TBI              AGACGACAATTTTACTTTATCAGTTTAATTATTAATAAAATTTTTTATGAAATCAAAACC
GHO              AACCGACTAAATTATTTATTTGTAATAATTACAAATACACTTCATAAAGAATTTAAAACT
                 ############################################################


                        190       200       210       220       230       240
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              CTTTTAGGAGAAACCGCTCTAACGGGGTCTGCTTTCATCTTTATCTCTTTATTTATTTTT
PAQ              CTAATCAGTAATAGTAAG---------CACACTATCATATTTAGCGCATTATTTTTTATC
BAU              ATTATCAATAACCCCCAATTAAAAGGAAGAACTTTTTTATTTGTTTCTTTATTTTTTGTA
SVI              ACCTTAGGGAAGACTACCCCCCTAGGGACTTCCTTGTTCTTAATCTCAATTTTAATTTTT
FOC              TTAATAGGCCCCAGAGCTTTTATAGGAAGATCTGTAATATTTATTACACTATTCATTTTT
FGR_AP           TTAATTGGAACACACGCTCCATCTGGAAGCACCTTATTATTTATTGGCCTCCTCATATTA
FGR_VL           TTAACCGGAACCCACGCTCCTTCAGGAAGAACAATTATATTTATTAGACTATTACTCATA
CTE              CTTTTAGGCCCAACATCTTTTAGAGGGAGTTCACTTCCTTTTATTGCTCTATTTACATTT
CAN              CTTTTAGGAAATACATCTTTTCAAGGGAGAACACTTCCTTTTATTGCCTTATTTATATTT
OOR              TTACTAAAGCCCATCAATCCCTCAGGAGGTTCAATTATTTTTATTGCCGTGTTATTTTTT
OVI              CTATTAGGCCCAACATCTTTCCCCGGCTCTTCGATCATATTTATTGCCTTATTTATATTT
TBI              TTGTTAGGACCTATTAGCGCACCCGGATCTGCTATTATATTTATTGCCTTACTAATAATA
GHO              TTATTAGGCTCTTCGGCCCATTTAGGTAGAACTTTATTTTTTTTATCTTTATTTATTTTA
                 ######                           ###########################


                        250       260       270       280       290       300
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ATTATTCTAAACAATTTTATAGGACTTTTTCCTTACATTTTTACCGCTTCCAGACACTTA
PAQ              TTTTTATTTAATAACTTTCTAGGGTTATTTCCTTACATTTTTACTAGCTCCAGTCACTTA
BAU              ATTTGCCTAAATAATTTTTTAGGGCTATTTCCTTATATCTTTACTGCTTCAAGCCATCTT
SVI              ATTATGCATAATAATGTTATAGGACTTTTGCCTTATATTTTTACTGCATCCAGACACATA
FOC              ATTGTAATTAACAACTTCATAGGTTTATTTCCTTATATTTTTACAGCGTCCAGTCATATA
FGR_AP           ATTGCTATTAATAATTTTTTAGGGTTATTCCCATATATTTTCACTTCAACTAGTCACCTA
FGR_VL           ATTGCCATTAATAATTTTTTAGGATTATTCCCGTATATTTTCACCTCAACAAGTCATCTA
CTE              ATTTTGGTAAATAATTTTTTGGGGCTTTTTCCCTATGTATTCACTGCCTCTAGCCACATA
CAN              ATTTTAATTAATAATTTTATAGGACTATTTCCTTACATTTTTACAGCATCTAGACATATA
OOR              ATCGTTTTTAATAATTTTATAGGTTTATACCCTTACATTTGCACTAGAACAAGACATTTA
OVI              ATTTTAATAAATAATTTTATAGGCCTATTTCCTTATATCTTTACAGCCTCAAGACATATT
TBI              ATTATATTTAATAACTTCATAGGGCTATTCCCCTATATTTTTACAAGTACTAGTCACCTT
GHO              ATTGTTTTTAATAATTTTTTTGGACTATTCCCTTATATTTTTACTAGTACTAGTCACTTA
                 ############################################################


                        310       320       330       340       350       360
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ACTTTAACGTTAGCTCTTGCCCTACCCCTCTGATTAACATTCATAATTTTTGGTTGAATA
PAQ              GTTATAAATTTAAGAGTAGCTGCCCCTATGTGAATGTCTTTTATACTATATGGTTGAATT
BAU              GCTATAGCTTTAACCTTAGCCCTTCCGCTATGGTTATCATTTATATTATATGGATGAATT
SVI              ACAATAACCTTGACCCTGGCCCTTCCTTTTTGAATATCACTTATACTCTTTGGGTGAATT
FOC              ACATTAACCCTAACCCTAAGACTACCTATTTGAATTTCACTAATATTATTAGGTTGAATT
FGR_AP           GTAACTGCTATTTCATTAGCTGCCCCATTATGACTAGCTTTCATACTCTACGGATGAGTT
FGR_VL           GTGACGGCTCTATCGTTAGCAGCTCCCTTATGGTTAGCTTTTATACTATATGGCTGAATT
CTE              GCTTTAACTCTCACTTTAAGCCTTCCTTTGTGACTTTCATTTATAATATACGGGTGGGTA
CAN              ATTTTAACACTAACATTAAGATTACCTCTTTGATTAACATTCATAATATTTGGGTGAATT
OOR              GTTTGTTCCATAACTCTCTCGTTACCCGTGTGATTATCTTTTATAATCTACGGTTGGTTC
OVI              ACACTAACTTTAACTCTTGCTTTACCTCTTTGATTAACATTTATAATTTATGGTTGATTG
TBI              GTATGCTCTATAACCCTCTCCTTACCTCTCTGATTATCATTTATAGTATATGGGTGATTT
GHO              GTTATAACTTTAAGTTTAGCAGCACCAATTTGGCTATCCTTTATATTATTTGGGTGAGTT
                 ############################################################


                        370       380       390       400       410       420
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              AATAATACTAACCATATATTTGCCCACTTAGTGCCTCAAAGTACCCCATCAGCATTAATA
PAQ              ACACAAATAAACCATATGCTAGCCCACCTAGTACCTCAAAGTACACCAGGACCCCTAATA
BAU              AAGAATACAAAATTTATATTAGCTCATTTAGTTCCTTTAAGAACACCTAACGTCCTTATA
SVI              AATTCAGCTGTGAATATATTGGCACACTTGGTCCCCCAGGGTACCCCAGCTATGTTAATA
FOC              AATTATACAACTCACATATTTGCCCATTTAGTACCTCAAAGTACACCAGGGCCTTTAATA
FGR_AP           AATAATATGAAATTTATGTTTGCCCATCTAGTACCACTAAGTACCCCTAACCTACTAATA
FGR_VL           AATAATATAAAGCATATATTTGCCCATTTAGTTCCTTTAAGAACCCCTAATTTACTTATA
CTE              AACCACACTAAACATATATTTGCTCATTTAGTTCCCCAAAGAACACCAGGAGCTTTAATA
CAN              AATCAGACAAAGCACATATTTGCCCATTTAGTTCCGCAAAGCACCCCAGGTGCATTAATG
OOR              AAACATTATAATTATATGCTTGCTCATTTGGTTCCTCAAAGAACTCCTGGGCCTTTAATA
OVI              AATTCAACAAACCACATATTTGCTCATTTAGTGCCGCAAAGCACTCCTTCTTTGTTGATG
TBI              AATTTTTATAACCATATATTAGCCCACCTAGTACCACAAAGTACTCCATCAGTACTAATA
GHO              AAAAATACAAACCATATATTTGCTCATTTGGTTCCTCAAAGAACACCTGGTGTACTTATA
                 ############################################################


                        430       440       450       460       470       480
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              CCTTTTATGGTGTTAATTGAATCAATTAGAAATGTAATTCGCCCAATTACATTATCAGTT
PAQ              CCCTTCATAGTACTAATTGAAACAACTAGAAACCTAATCCGCCCAGGAACTTTAGCTGTG
BAU              CCATTTATAGTAATTATCGAAAGTGTAAGCAATTTAATCCGCCCAGGAACTTTAACTGTT
SVI              ATGTTTATAGTACTAATTGAAACAATTAGAAATATAATCCGACCTCTGACTCTAGCGGTC
FOC              CCATTTATAGTATTAATTGAATCTATTAGAAATGTAATTCGTCCTTTAACACTAGCTGTC
FGR_AP           CCTTTTATAGTTTTAATTGAATCAATTAGAAATATTATCCGCCCTGGAACTTTAGCTGTT
FGR_VL           CCATTTATAGTGTTAATCGAATCTATCAGAAACTTCATTCGACCAGGAACATTAGCTGTA
CTE              CCTTTTATAGTATTAATTGAATCAATTAGAAACATCATTCGACCATTAACCTTGGCAGTA
CAN              CCATTTATAGTTTTAATTGAGTCAATTAGAAATGTAATTCGACCTCTAACTTTGGCAGTT
OOR              GTTTTTATAGTAATAATTGAAACTGTCAGTAACATTATCCGGCCATTAACTTTAGCAGTT
OVI              CCATTTATGGTGCTTATTGAATCAATTAGAAATGTAATTCGTCCGATTACTTTATCTGTA
TBI              TCTTTTATAGTAATTATTGAAACAGTTAGAAATATTATTCGACCATTAACATTAGCTGTT
GHO              CCATTTATAGTATTAATTGAATCTATTAGTAATATAATTCGACCCGGTACATTAGCAGTT
                 ############################################################


                        490       500       510       520       530       540
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              CGACTTATGGCTAATATAGTAGCAGGACATTTACTTATAACTCTTTTAGGTAATCAAACT
PAQ              CGTCTTACAGCTAACATAATTGCAGGCCACCTTCTAATGACTTTACTAGGAAACCAAACA
BAU              CGTCTTTCTGCTAATATAATTGCCGGACATCTTCTTCTCTCTCTACTTGGTGACCAAACC
SVI              CGGCTCACTGCAAATATGATTGCTGGACATCTACTAATGACCTTAATTGGAAATCAGGCA
FOC              CGATTAATGGCCAATATAGTAGCAGGACACTTACTTATAACATTATTAGGAAACCAAACA
FGR_AP           CGTTTATCAGCCAATATAATTGCAGGCCATTTATTATTAACTCTTCTAGGAAACCAAACT
FGR_VL           CGTCTTTCAGCTAATATAATTGCTGGACACTTACTACTAACTCTCCTTGGTAATCAAACT
CTE              CGTCTAATAGCCAATATAGTAGCAGGACATTTATTAATAACTTTATTAGGAAACCAGACT
CAN              CGTCTTATAGCAAATATAGTTGCCGGACATCTACTAATAACTCTATTAGGAAATCAAACT
OOR              CGTCTATCCGCGAACATAATCGCTGGCCATTTACTAATAACTCTTTTAGGGAATCAAACT
OVI              CGATTAATGGCTAACATAGTGGCAGGGCACTTATTAATAACTCTTTTAGGTAACCAAACA
TBI              CGACTTTCGGCTAATATAATTGCAGGTCATCTTCTTATAACATTATTAGGTAATCAAACA
GHO              CGTCTTACTGCCAATATGATTGCAGGACATCTTTTAATAACTCTATTAGGTAACCAAACT
                 ############################################################


                        550       560       570       580       590       600
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              GCAACAGCTTCT---CATTTTATTCTAATAAGATTAATTATTACTCAGATCCTTTTATTA
PAQ              GCCTCTAGTTCA---ACCGCTGTATTAATTATTCTTCTTATCGTTCAAGTACTTCTCATT
BAU              AACTTTCTATCTAATTCTTCTATAGTTTATATTATAATTACCCTTCAAATTGCTCTACTT
SVI              GCTGTAAGATCA---ATAATTACTCTATTAGGGGTAATAAATGCTTTCATTTTGTTAACA
FOC              GCAAATGCTAGA---AGATTTGTCTTAATAGGATTAATTTTAACCCAAATCTTATTACTT
FGR_AP           TCAGCTTCTTCT---TCTTTTATTTTAATCATTATATTATTTATCCAAATCTTATTACTA
FGR_VL           TCTTCATCTTCT---TCACTAATTCTTATAATTATATTATTTTTACAAATTACCCTTCTT
CTE              TCTGCAGCGTCT---GGAATTTTATTAATAGGATTACTTTCAACACAAATTCTCCTTTTA
CAN              GCGTCTGCCTCA---GGAATTATTTTAGCAGGACTTCTAGCAACTCAAATCATACTATTA
OOR              GCTATTTCTTAC---AATTTTACTTTACTCACCCTTTTAATTACCCAAATTCTTCTTTTA
OVI              GCAGTAGCATCA---AATTTCATTTTGATAAGATTAATTATTACACAAATTCTTCTTCTT
TBI              GCCTCAGCACAT---TTATTTACGTTATACTTACTTCTAGGAACTCAAATTATTTTATTA
GHO              GCTTCTGTACCA---GCCATTTTAATTGGAATTCTTCTTTTTGTACAAGTTCTACTATTA
                                      #######################################


                        610       620       630       640       650       660
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ACTCTGGAAAGAGCGGTTGCTATTATTCAATCCTATGTGTTTGCTGTTTTAACTACTTTA
PAQ              ACTTTAGAAGGGGCGGTAGCTATTATTCAAGCATATGTGTTCTCTATTCTCACCACGCTA
BAU              ACCCTTGAATCAGCAGTTGCTATTATTCAAGCATATGTATTCACAATTTTATCCACACTT
SVI              ATTCTTGAGATGGCAGTCGCATTTATTCAAGCCTACGTATTTGCTGTTCTTTTAACCCTT
FOC              ACTTTAGAATCAGCAGTTGCAGTAATTCAATCTTATGTGTTTGCAGTATTGTCCACTCTG
FGR_AP           CTATTAGAATCCGCTGTAGCTCTAATTCAAGCATACGTATTCGCAGTCCTTTCATCTCTT
FGR_VL           CTTTTAGAGTGTGCAGTGGCTTTAATTCAAGCTTATGTATTTGCCGTTCTTTCTTCTCTA
CTE              ACTTTAGAATCAGCAGTAGCCGTAATTCAATCTTATGTTTTCGCAGTTTTATCTACCCTT
CAN              ACTCTAGAATCAGCGGTAGCCGTTATTCAATCGTATGTATTTGCCGTTCTTTCAACTTTA
OOR              ACCTTAGAGTCTGCTGTTGCTATTATTCAATCCTATGTATTTGCCGTCCTTTCATCACTT
OVI              ACTTTAGAAAGAGCAGTAGCTATTATTCAATCTTACGTTTTCGCCGTATTAACAACATTA
TBI              GTACTAGAATCTGCTGTCGCTCTAATTCAATCTTACGTATTTGCTGTTCTATCGTCTCTT
GHO              CTTCTTGAGTCAGCGGTTTCTATTATTCAAGCTTATGTTTTCTCAGTTCTAGCCACTTTA
                 ############################################################


                        670       680
                 =========+=========+====
OCI              TACGCTAGAGAAATTACGTCCCAT
PAQ              TATTCCAGAGAAGTG---------
BAU              TATTCCTCTGAAGTAATT------
SVI              TATGTTAATGAAATT------CAC
FOC              TATGCTAGAGAAATCACATCTCAT
FGR_AP           TATTCTAGCGAAGTAGTTGCTCAT
FGR_VL           TATTCAAGAGAAGTAATTAGTCAT
CTE              TATGCTAGTGAAATCACTTCACAT
CAN              TATGCTAGAGAAGTAACATCACAC
OOR              TATTCTAGTGAAAGAACT---CAT
OVI              TATTCTAGAGAAATTACGTCACAC
TBI              TACTCTAGTGAAAGTTCA---TTT
GHO              TATTCTAGAGAAATTACTACTCAT
                 ############            






Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 7 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 11 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 4 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: None
Flank positions of the 3 selected block(s)
Flanks: [7  186]  [214  540]  [562  672]  

New number of positions in atp6.fas_checked.fasta.aligned.fastafasta:  618  (90% of the original 684 positions)