Processed file: nad6.fas_checked.fasta.aligned.fasta
Number of sequences: 13
Alignment assumed to be: Codons
New number of positions: 300 (selected positions are underlined in blue)
10 20 30 40 50 60 =========+=========+=========+=========+=========+=========+ OCI ------------ATTTAT---TTATTTTTAAGTATGTCTACAATAATTAGTATTAGATTA PAQ ------------ATACTA---ATAAATTTTATTGGGATGATTATTTTCATAATTTTAATA BAU ------------ATATCA---TGAATACTTTTAGTTATACTTCTACTCTCAATTTCAATA SVI ATGAACTTTTTAATAAAA---TTAATAGTTCTATTTTCTTCATTTATAAGCTTTCTAATC FOC ------------ATTAAA---TTAATTATAATAAGTTCTATTATTATTTCTTCAATCATC FGR_AP ATA---------ACAACTCTAATTTTTATGGGCCTAGCTGTATTTAATTCAATTTGCTTA FGR_VL ------------ATAGCTTTTTTATTTATCCTGCTAACTATTAATAATTCTATTTGATTA CTE ---------------------ATAATTTTATTGCTCTCTTTTATAATCAGCAACTTATAC CAN ATT---CTTGATATTAAA---TTAATATTTATCTCCTCAGTTTTTAGTAGTATAATAATT OOR ATT------------------ATTTTTTTAACGTTATCTGTGATTGTAAGAACTTTATTT OVI ------------ATTATA---TTATTTATAATATTATCTGCAACTATTAGTATAACTTTA TBI ------------ATAAAATTTATAATTATTTTTACATCCTCAATATTAAGAAATATATTC GHO ATTTCTTATGGTATAAAA---ATTTTATATTTTTCTACTATTATTATAGCTTCAATTTTT #################################### 70 80 90 100 110 120 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Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 7 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 11 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 4 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: None
Flank positions of the 2 selected block(s) Flanks: [25 255] [439 507] New number of positions in nad6.fas_checked.fasta.aligned.fastafasta: 300 (55% of the original 540 positions)