Processed file: atp8.fas_checked.fasta.aligned.fasta
Number of sequences: 13
Alignment assumed to be: Codons
New number of positions: 75 (selected positions are underlined in blue)
10 20 30 40 50 60 =========+=========+=========+=========+=========+=========+ OCI ATTCCTCAAATATCCCCATTGATATGATTAATTTTATTTTCTTTATTCTCAGCCGCTTTA PAQ ---------ATATCACCTATCAACTGAATTACCCTATTCCTGCTATTTAATGTGACAGTT BAU ATACCACAAATATCTGCTATAAATTGAATTATTTTATTAATAATGTTTATTATCTCCCTT SVI ATTCCTCAAATAGCCCCAATAATATGAAATGCGATCTTTTTAAGTACATCACTAATCCTC FOC ---------ATATCACCTCTCAAATGACTAAATTTGTTTATTTTATTTTGTGCACTTTTA FGR_AP ATCCCTCAAATATCACCTTTTAATTGAACCTTAATATACACTTTATTCTTAATCTCTTTC FGR_VL ATTCCTCAAATATCCCCTTTAAACTGAATCTTACTTTTAATAATATTCCTAACATCCCTC CTE ATCCCACAAATAGCTCCTTTAAGATGATTGATTCTTTTTAGAAGATTTTCCTTTTTATTC CAN ATCCCTCAAATAGCCCCATTAAGATGATTAATTCTATTTTTTATATTTTCGATTTTATTT OOR ATCCCACAAATATCCCCCATACCCTGGTTATTTCTTTTTGCCATATTTACATTAATTTTT OVI ATCCCTCAAATATCTCCTCTAATATGATTAACTCTTTTTATATTATTTAGTTTATTACTA TBI ATTCCTCAAATAGCCCCTATAAATTGACCCTTTATATTTATTATATTTATTTTAATCTTT GHO ATTCCACAAATATCCCCTATAAACTGAGGTTTTCTATTTATCACCTTTATTTTTATCTTA ################################################### 70 80 90 100 110 120 =========+=========+=========+=========+=========+=========+ OCI ATAATTAGTATGGTAAAAACATACTTT---AACAATATTAAAGCACCCTCTAATGAGCAA PAQ TTTTTAATTGTAGTAAAACTATACTTCTTACCATCACTAAAATTTTTAACTTCCTTCCAA BAU CTCATAATATCATGTAAACTATATAACTTTACTTCATCTAAATTAAATTTTCTCTTAAAT SVI ATAGTTACCCTGTCTAAATCTTACTTCGTTCTAGGGAGTAAAGAAACTTCAAACATAGAG FOC ATTTTTATTGTTATCAAAATATACTATCTAAAATATTCATCCAATAGATTAAATTTAATA FGR_AP CTAATAATTATAATAAAAATCTTCTCTAAATCCCCTTCTTCTAGATTTAAACCTAATAAA FGR_VL CTCTTAATTAGTATTATAATCTTTTCTAAAACTTCATTTAATATTTTTTTATCTAACACT CTE GCATTAGGAATAATAAAAATCTTTTTT---ATTTTTTCTAGCGCTGCACCCTCTAAGGAA CAN CTTTTTAGAATAGCTAAAATATTTTTT---TCTAAAATAAATCTTTCATTTACTTACACA OOR ATTTGTATTAATAATAAAATTTTTTTCCACTCCTTAAATTCTTACTCTAATAATAACCCA OVI ATTAGCGCCATAATTAAAATCTATTTCATGAACAACAAAAGCATTAAATTAAATGAGACA TBI ATTTTATCCATCAATATGATTTACTTCATAACTTATATACAATTAAAAACAAAAAATGTT GHO ATTTGTTCTATAATTGTTATTTATTTTAATGTATTTACTCAGACTATTATTAATCAAATA ######################## 130 140 150 160 170 180 =========+=========+=========+=========+=========+=========+ OCI AAACCTATT---------AACCAGGTCCAAAATAAATAT---------------ATTATA PAQ CCACCCCACTCATCTAATCCAAACAAATTAAATTCTTCC---------------CCCTCC BAU ATGCCTTATTCT------ACCCCTGTCTTTAATAAA------------------------ SVI ------------------GGGGAAAAAACAGAGAAATTA---------ATTTCTAATAAA FOC ------------------AAAAATGTTAATAATGAAAAT---------------ACAATT FGR_AP GATTCTATTTTA---ACAAACTTATTAAATAACAAT---------------------AAA FGR_VL TTGCCTTCTATA------AATCAAAAAACTATTAAT---------------------ATA CTE GATTGTATT---------AATACAACAATAACTATAAGA---------------GATATG CAN CCCGCT------------AATAAGACAGAAACCAAATCT---------------CCCCTA OOR ACATTAGTTCTT---ACTGACGGAAAAAGAAATTCC---------------------TTT OVI CCAGCTATA---------GGTGAAAAAAATAATAAC---------------------AAA TBI ATTAATCACACT------TCTATGACTAATAACAAAATT---------------AACAAC GHO ------------------AATAAGTCTTCAACTAATATTTTAACAAGATTAAGCCATAAA 190 =========+== OCI GCTTGAAAATGA PAQ AATTGAAAATGA BAU ---TGATCATGA SVI GAATGAATATGA FOC AATTGAAAATGA FGR_AP ATTTGAAAATGA FGR_VL CCCTGAAAATGA CTE GAATGAAAATGA CAN ACCTGAAAATGA OOR CTTTGGCTATGA OVI ATTTGACAATGA TBI TATTGAACATGA GHO AGCTGAAAATGA
Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 7 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 11 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 4 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: None
Flank positions of the 1 selected block(s) Flanks: [10 84] New number of positions in atp8.fas_checked.fasta.aligned.fastafasta: 75 (39% of the original 192 positions)