Processed file: nad3.fas_checked.fasta.aligned.fasta
Number of sequences: 13
Alignment assumed to be: Codons
New number of positions: 336 (selected positions are underlined in blue)
10 20 30 40 50 60 =========+=========+=========+=========+=========+=========+ OCI ---ATATTTTTACCTATTGTTCTTTCATTAGCTTTATGCTCTGTATTAATTTTTTTAAAC PAQ ATAATTATACTTCTGATTATAGTCGGGCTCGGCCTCCCTCTAGCTTTAATTCTAGTTAAC BAU ---ATTATATATATAATTACATTGGCTGTTATTTTAACAATTATTTTATTTTGCATAAAT SVI ATAATTTTATTAATCATGGTATTAACACTAGTGATTTCAACAGCCCTTATCATATTAAAT FOC ---ATAATTTTAATTATTGTATTATCTATGGGGTGATCAGTTATTTTAATCATCCTAAAT FGR_AP ATACTCATGTGAATCATTATTTTAATTGTATTACTTCCGCCTATTTTAATAGGATTAAAC FGR_VL ATACTTTGATTAATTTTTATTATCTCTCTTGTGCTGCCCCCTATATTAATAATAATTAAT CTE ---ATATTAGTACTTCTTCTGATTTCTATAGGATTACCCCTAGCCTTGATTATCTTAAAC CAN ATAATTACCACTATTATTATTACATCTCTAGGGCTACCCCTAGCTTTAATTATATTAAAT OOR ---ATTATCCAAATTTTTTCTTTAGCCCTAATTTTAGCTCTTTTTTTAATCTTGCTTAAT OVI ---ATAATTTTGACCGTAGCCTTATCTTTAATTTTATGCTCACTTTTAATTTTTGTAAAC TBI ---ATAATAATAATTCTTATTCTAGCCTCAATTATCTCATTATTTATAATTATTTTAAAT GHO ---ATTTCTTTAATTATTATTTTAATTATTGTGCTCCCTTTAATTTTAATTTCTATTAAC ######################################################### 70 80 90 100 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------------------ FGR_VL ------------------ CTE ------------------ CAN ------------------ OOR ------------------ OVI ------------------ TBI ------------------ GHO ------------------
Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 7 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 11 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 4 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: None
Flank positions of the 1 selected block(s) Flanks: [4 339] New number of positions in nad3.fas_checked.fasta.aligned.fastafasta: 336 (67% of the original 498 positions)