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New number of positions: 1479 (selected positions are underlined in blue)
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1680 =========+=========+=========+=========+=========+=========+ OCI TTGGATCAAGGTTGAGTTGAATTTTTTGGGGGGCAAGGTGTTTACTCCACTTTACGGTTT PAQ TTAGACCAGGGTTGAGCAGAAGAGTTAGGAGCTCAAGGCCTCCACAAAGTAGGGGCTAAG BAU ATGGACATAGGTTGAGTAGAGTATTATGGGGGTCAAGGGGGTATAACTGTTGTGATAAAA SVI TTAGATCAGGGTTGATTTGAGTACATGGGCTCTCAGGGGATTTACAGTTCTGCTTCTAGT FOC ATAGACCAAGGTTGGTTGGAATATATAGGAGGACAAGGAGTAATTTTATACTTTTCAAAT FGR_AP ATAGATGGAGGATGGTTAGAATTTATGGGAGGTCAAGGAGGAGTCTCCCACCTCATGGCT FGR_VL ATAGATAATGGATGATTAGAGATTTTTGGGGGACAAGGGGGTATAAAATATATTATAATA CTE ACTGATCAAGGATGACTTGAATTTTTTGGGGGCCAAGGAGTTATTAGAAAAGCAAGAAGT CAN GCTGACCAAGGTTGAATGGAATACGCAGGAGGTCAGGGGGCAATCAATAAGATAGGGTCT OOR TTAGATCATGGGTGGGTGGAGTATATAGGAGGCCAAGGTTTAATGAATTTTTATAAAAAT OVI TTAGACCAGGGTTGAGTAGAAATTATTAGCGGACAAGGTATGTTTATAGTAATACGTAAA TBI TTAGACCAAGGTTGAGTAGAATATATAATGGGACAAGGATTTATATTAAAAATTAGTGTT GHO ATAGATAATGGTTGGTTAGAGGAAATAGGTGGTCAAGGTGGAATACTTAAATTAATAAAA ############################################################ 1690 1700 1710 1720 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OCI --------------------------------- PAQ --------------------------------- BAU --------------------------------- SVI AGTGTTGAAGTTACTAAGATAGTTTTAAACTTT FOC --------------------------------- FGR_AP --------------------------------- FGR_VL --------------------------------- CTE --------------------------------- CAN --------------------------------- OOR --------------------------------- OVI --------------------------------- TBI --------------------------------- GHO ---------------------------------
Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 7 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 11 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 4 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: None
Flank positions of the 8 selected block(s) Flanks: [70 117] [136 546] [586 1008] [1021 1143] [1150 1242] [1303 1428] [1435 1452] [1528 1764] New number of positions in nad5.fas_checked.fasta.aligned.fastafasta: 1479 (80% of the original 1833 positions)