Gblocks 0.91b Results

Processed file: nad4L.fas_checked.fasta.aligned.fasta
Number of sequences: 13
Alignment assumed to be: Codons
New number of positions: 240 (selected positions are underlined in blue)

                         10        20        30        40        50        60
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ------ATTTATTATTTAGTTTTTTTTATTGGTTTATTAAGAGGATTTTGAATTTATTGT
PAQ              ---------------------ATAATTATAGGTGCTTTTGTTAGAATAGCTGTGTATTCT
BAU              ---------------ATAGTTTTTATAATATGTTTTTTAATAGGAGGTTTAAAAATAAGA
SVI              ---------ATAAATTATGTTTTTTTTTTAGTTATTTTTAGGGGCTTGTACACATTTTGT
FOC              ------------ATAATAACAAGATTTTTTATTTTTTCTTTCTGGAATGTGAATTTTGTG
FGR_AP           ---------ATATATATCTCCTTATGAATTAGTTTAATTTTTGGGGCCTTAAGATTTAGT
FGR_VL           ---ATAATTATGTTATCTAGTTTATGGATTAGTTTTATTTTAGGGTTTATGAGATTTAGC
CTE              ---ATACTGATAATTATAGTTGTTATATTTATTTTAATTTCAGGGATATGAATCTTTTCT
CAN              ------------ATAATAACAAGATTTTTTATTTTTTCTTCGGGCCTATGAATTTTTTGT
OOR              ------ATAATTTTATTTATAGGGTTACTAATCATTACAGCTGGATTATGAGTGTTTAGA
OVI              ---------------ATAGTTTTGGGTTTAGGCTTATTTAGAGGACTTTGAATTTTTTGC
TBI              ---------ATATTTATGGTTAGCGGTTTAATTGTTTTTAGAGGATTATGGATTTTTTGT
GHO              AAACTTATTACTTGATTTTATTATTTTGTTTTTATTTTTATTGGGGTATGGGTATTTAGT
                                               ##############################


                         70        80        90       100       110       120
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              TCTACACGAGAGCATTTACTTTCTGTTTTAATAAGATTAGAGTATTTAGCGTTAATTATA
PAQ              TCTTTTGATAAGCATTTACTTAGAACTTTATTGGCGTTAGAGTCTATGGTTTTAGTGGTT
BAU              AAAGAATTGAAACATTTGTTAATAGTGTTGTTAAGACTAGAGTTTATAATATTAATATTA
SVI              TCAAAGCGGAAGCATATCCTTCTTATACTTCTTAGTATTGAATTCATAGTCTTAGGTTTT
FOC              TCTAAGCGTGAACATCTTTTATCTATACTATTAAGATTAGAATATATGAGTTTAGGTGTA
FGR_AP           CTTTTAATAAAGCATTTATTAGGAATACTTTTAAGATTAGAGTTTTTAGTGTTGTTAGTA
FGR_VL           GTCATAAGAAGTCAATTACTTGGTATATTACTTTTATTAGAATTTATAGTTTTGTTAGTT
CTE              TCTAAGCGAGAGCATCTTTTATCCGCGTTATTGAGATTGGAGTATATAAGAATAGGGGTT
CAN              TCCAAGCGTGAACATCTTCTTTCTGTTTTATTGAGTCTAGAATTTATTAGTTTAGGTGTG
OOR              TCTAAACGTAAACATATTCTTCTTATACTTCTTAGTTTAGAATATATCGTTTTAGGAATT
OVI              TCCACCCGAGATCATCTATTGTCAACTTTATTGAGCTTAGAATATATAGCTTTAATTATA
TBI              TCTAAACGTAAGCATCTTTTGTTAACTTTATTAAGATTAGAATATATTGTTTTAGGTATT
GHO              TCAAAAAGTAAGCATTTATTAAGAACTTTATTAAGATTAGAGTTTATTGTTCTTGGAATT
                 ############################################################


                        130       140       150       160       170       180
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              TTT---TTAGTATTCATTATTTCTTTTTCAGGGGGGTCTCTTTATTATTCTTTTATATAT
PAQ              TTT---ATATGTGTTGTATTGGTTTTATCGTTGGGTCAGGGGTATATTTCTTTGTTTTAT
BAU              TTTGCTTTATCTGTGGTAGTTAGAGTCCAATTTATGGGTGTTTACTTATTTATTATTTTA
SVI              TTC---TTTTCTATTTTATTCTCCCTTAGTTTCAGGAATCTATTCTTTTCCTTAATTTTC
FOC              TTT---TATATTTTTTTTATATTCATGGGGACTAGAGATTTATTTTATTCTTTATTTTTT
FGR_AP           TTT---TCATTTATAGTTTTTATACTTAATTTTGGTGTTACTTTTATATCTATAGTGTTT
FGR_VL           TTC---TCTTCATTCATATTTGTTTTTAGATCGGGAGCTTCTTTTATTGTAGTTGTTTTT
CTE              TAT---TTATTATTTTTATTTATGCTCAGAAATTTAGATTTATATTATTCTTTGGTTTTT
CAN              TAT---CTTTTACTTTTACTTTTATTAACCAATTTAGATATATTTTTTTCTTTAATTTAT
OOR              TTT---TTTATTATACTAAGAAGACTGGGGGCAGGGAGATTATTCTTTTCTCTTTTGTAT
OVI              TTT---TTATTTTTTGTTTTTTCTTTATTTTTTATGCCTTTATATTATTCTTTAATTTAT
TBI              TTT---TTAATATTTTTTGTTATTATAAGGAGAGGTTATTTATTTTATTCATTAATTTAT
GHO              TTT---ATTTATTTTTTTTATTTTTTAAATTACACTATAATATTTTGTTCGTTAATTTAT
                 ###   ######################################################


                        190       200       210       220       230       240
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              TTAATTATGGCTGCTTGTGAGGGTGCTTTAGGACTATCCATTTTAATTAATATAAACCGC
PAQ              CTGGTTGTTTCAGTTTGTGAAGGGGCGTTAGGTTTAACGCTACTCGTAGAAATGTCTCGG
BAU              TTAATTTTTGGTGTATGTGAAGGGGCTTTAGGGTTGACTTTACTAGTAGTATTGGTACGC
SVI              TTAACATTCACCGCCTGTGAGGGGGCCCTGGGTCTGGGGGTGTTAATTAATATAAGTCGA
FOC              TTAACTTTCACTGCTTGTGAAGGCGTTATAGGGTTATCTATTTTAGTAATTATAATGCGA
FGR_AP           TTGGTTTTTAGTGTTTGCGAAGGGGCTTTAGGTTTAACAATTTTAGTAAACATATCTCGA
FGR_VL           CTAGTTTTTAGTGTGTGTGAAGGAGCTTTAGGGTTGACAATTTTAGTGGGGTTCTCCCGT
CTE              ATTACCTTTACTGCTTGTGAAGGGGCTTTGGGTCTCTCTATTTTAGTAATAATGAGACGC
CAN              ATTACATTTACTGCTTGCGAGGGAGCTTTAGGGTTGTCAATTTTAGTTATAATAAGACGT
OOR              TTAGGGTTTAGAGCTTGTGAGGGGGCTTTAGGACTTTCTATTTTAGTAACCATAAGACGA
OVI              TTAATTATGGCTGCATGTGAAGGGGCCTTAGGTTTATCTATTTTAATTAATATAAATCGC
TBI              TTAGTTTTTGGAGCATGTGAAGGGGCATTAGGGTTGTCAATTTTAGTAACAATAAGTCGG
GHO              TTAATTTTTACAGCTTGCGAAGGGGCTTTAGGTTTAACAATTTTAATTAGAATATCTCGT
                 ############################################################


                        250       260       270       280       290
                 =========+=========+=========+=========+=========+=
OCI              ACTCACGGGGGGGATTATTTTAAAAGATTTAATTTATTTTTAGTT------
PAQ              GTTCACGGTAACGATTACTTAAATTCTTTTTCTTTAGTCTAT---------
BAU              AAAATTGGGGGGGATTATTTAAATATTTTTGGGTTATTAATG---------
SVI              GTTTACGGGACAGATTATTTTAGAGTATTTAATTTTAATGTATATGATAAT
FOC              ACTCATGGGGGTGACTATTTTAAGTCTTTTAATTTAGTT------------
FGR_AP           GCCTTCGGGGGAGACTATTTGAATATTTTTAGCCTAATAATT---------
FGR_VL           GCATTTGGAGGAGATTATTTGAATGCTTTTAGATTAACTGTA---------
CTE              ACTCATGGAGGTGATTATTTTAAAAGATTTAATTTAATT------------
CAN              ACCCACGGAGGTGATTATTTTAAAAGATTTAGTTTGTTT------------
OOR              ACACATGGAGGAGACAATTTTRATTTATTTAATCTGAAT------------
OVI              ACTCACGGGGGAGACTACTATAAAAGATTTAATTTGTTTTTACTT------
TBI              ACTCATGGGGGGGATAATTTTAATATATTTAATTTAAAT------------
GHO              ACTCATGGTGGAGATTATTTTGGTTCTTTTAGTTTAGATTAT---------
                 #################################                  






Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 7 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 11 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 4 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: None
Flank positions of the 2 selected block(s)
Flanks: [31  123]  [127  273]  

New number of positions in nad4L.fas_checked.fasta.aligned.fastafasta:  240  (82% of the original 291 positions)