Gblocks 0.91b Results

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Number of sequences: 13
Alignment assumed to be: Codons
New number of positions: 336 (selected positions are underlined in blue)

                         10        20        30        40        50        60
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ---ATATTTTTACCTATTGTTCTTTCATTAGCTTTATGCTCTGTATTAATTTTTTTAAAC
PAQ              ATAATTATACTTCTGATTATAGTCGGGCTCGGCCTCCCTCTAGCTTTAATTCTAGTTAAC
BAU              ---ATTATATATATAATTACATTGGCTGTTATTTTAACAATTATTTTATTTTGCATAAAT
SVI              ATAATTTTATTAATCATGGTATTAACACTAGTGATTTCAACAGCCCTTATCATATTAAAT
FOC              ---ATAATTTTAATTATTGTATTATCTATGGGGTGATCAGTTATTTTAATCATCCTAAAT
FGR_AP           ATACTCATGTGAATCATTATTTTAATTGTATTACTTCCGCCTATTTTAATAGGATTAAAC
FGR_VL           ATACTTTGATTAATTTTTATTATCTCTCTTGTGCTGCCCCCTATATTAATAATAATTAAT
CTE              ---ATATTAGTACTTCTTCTGATTTCTATAGGATTACCCCTAGCCTTGATTATCTTAAAC
CAN              ATAATTACCACTATTATTATTACATCTCTAGGGCTACCCCTAGCTTTAATTATATTAAAT
OOR              ---ATTATCCAAATTTTTTCTTTAGCCCTAATTTTAGCTCTTTTTTTAATCTTGCTTAAT
OVI              ---ATAATTTTGACCGTAGCCTTATCTTTAATTTTATGCTCACTTTTAATTTTTGTAAAC
TBI              ---ATAATAATAATTCTTATTCTAGCCTCAATTATCTCATTATTTATAATTATTTTAAAT
GHO              ---ATTTCTTTAATTATTATTTTAATTATTGTGCTCCCTTTAATTTTAATTTCTATTAAC
                    #########################################################


                         70        80        90       100       110       120
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              TCAATAATTGGGAAAAAATCAACTAATGACCGTGAAAAACCGTCTCCATTTGAATGTGGA
PAQ              ACAATCATATTCAAAAAAAGCTACATCTCTAAAGAAAAACTATCCGCATTTGAATGTGGA
BAU              TCTTTTCTTTTTAAAAAACATTCTTTCTCTCGTAATAAAAGATATGCATTTGAATGTGGC
SVI              TCATTAATTTCATCAAAAAAGGGGACCTCACGAGAAAAGTTATCAGCCTTTGAATGTGGT
FOC              TCCACAATTAGAAAAAAAAAAATTATAGAACGAGAAGCCCCATCAGCATTTGAATGCGGG
FGR_AP           CTTCTTTTGTTTAAAAAAAATTTTTTAAGCCGAGAAAAATACAGTCCATTTGAATGCGGG
FGR_VL           TCTATTTTATACAAAAAATACTCCTCTTCACGTGAGAAACCAAGTCCATTTGAATGCGGG
CTE              TCAACTATTGCTAAAAAATCTACAATCGAGCGAGAAAAACCTTCAGCATTTGAATGCGGA
CAN              ACAACAATTTCAAAAAAATCTCTCATAGAACGAGAAAAACCATCAGCATTTGAATGCGGA
OOR              TCAGTAATTTCATCCAAATCTTTTAATGACCGAGAAAAGCCTTCATCCTTTGAATGTGGG
OVI              TCAATTATTGGTAAAAAATCAACTTCAGACCGAGAAAAATTAACTCCTTTTGAGTGTGGG
TBI              TCAATAATTGCTAACAAATCTATAATAGACCGAGAAAAAATCTCCCCATTTGAATGTGGA
GHO              TCAACTTTATTTAAAAAAGATTTAATTAGTCGAGAAAAAATAAGTCCATTTGAGTGTGGC
                 ############################################################


                        130       140       150       160       170       180
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              TTTGACCCTAAAAGATCAGCGCGTGTGCCTTTCTCGCTACGGTTCTATTTGGTAGCCTTG
PAQ              TTTGACCCAAAAAACCAAGCTCGCCTTCCCTTCTCCATACGTTTCTACTTGATCGCTATT
BAU              TTTGACCCATACTCATCGGCACGAACCCCATTTTCCATTAAATTCTACTTAATCTCAGTG
SVI              TACGACCCAAAAAGTCCATCCCGCCTGCCCTTCTCAATACAATTCTTTTTGATTGCAGTG
FOC              TTTGAACCTAAAAGATCAGCTCGAATACCTTTCTCACTACGATTTTATTTGATTGCAAGA
FGR_AP           TTTGACCCTAAACTTTTAACTCGTAATTCTTTTTCCCTAAAATTTTACTTAATTGCTATT
FGR_VL           TTTGACCCAAAATTATTAACTCGAAACTCATTTTCTCTAAAATTTTACTTAATCGCTGTA
CTE              TTTGACCCCAGAAGATCCGCCCGAATCCCGTTTTCCCTGCGGTTCTATCTTATTGCAGTG
CAN              TTTGACCCTAAAAGATCGGCTCGGTTACCATTTTCTCTTCGATTCTATCTAATCGCAGTA
OOR              TTTAATCCATTATTTTTCTCACGAACTCCTTTTTCCACTCAATTCTTTCTTATTGCTGTA
OVI              TTTGATCCTAAAAGATCTGCTCGTGTTCCATTTTCACTCCGATTTTATTTAGTAGCCTTA
TBI              TTCAACCCACTTTACTACGCGCGAGCTCCATTTTCTATGCGCTTCTTCTTAATTGCTATT
GHO              TTTGACCCTAAAAATACTGCCCGGCTACCATTTTCCATACGATTTTATTTAATCGCAGTA
                 ############################################################


                        190       200       210       220       230       240
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              GTGTTTTTAATTTTTGACGTAGAAATTACCTTAATTCTACCTATACCAGTATTAATAAAT
PAQ              ATTTTTCTTATTTTCGACATCGAACTAGCCTTAATTATACCATTCCCGCTAGTCCACTCT
BAU              ATCTTCCTAATCTTTGATATTGAAGTAACTTTAATTCTTCCCATTCCCTTAATTACTTAC
SVI              ATTTTCTTGATCTTTGATGTTGAAATCACCCTAATCATCCCCATGCCGATAATTTTGAAG
FOC              ATCTTTTTAATTTTCGATGTAGAAATTGTCCTTTTAATTCCCGTTCCCATCATTTATAAT
FGR_AP           ATTTTTCTAATTTTCGACATTGAAATTTCCTTAGTTCTTCCCATTCCGCTTATCTCTCAA
FGR_VL           ATTTTTTTAATCTTTGATATCGAAATTTCATTAGTTCTACCAATCCCTTTAATTATATTT
CTE              ATCTTTTTAATTTTTGATGTAGAAATCACTCTTTTGATTCCTATTCCTATTATCATGACT
CAN              ATTTTTTTAATTTTCGACGTTGAAATTACCCTAATTATTCCTATCCCAGTTATTATAATA
OOR              ATTTTTTTAATTTTTGATGTAGAAATTACTTTAATTTTACCTATTCCAATAATTTTGCAT
OVI              ATTTTTTTAATTTTTGATGTAGAAATCACACTTATTATACCAATCCCTATTGTATTTCAA
TBI              ATCTTTCTAATTTTTGATGTAGAGATTACATTAATTATACCACTTCCAATTATACTATAT
GHO              ATTTTCTTAATTTTTGATATTGAAATTGCCCTTATCTTACCTATTCCATTTATTTTTAAT
                 ############################################################


                        250       260       270       280       290       300
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              CAATCAAACAGTCTTGTCATGTTTACACTAATTATTTTTTTTTTAATAATTTTAATTATT
PAQ              CTTCAAGAACAAGAATTCATTAACTTTACGTTCACTTTTTTTACTTTTATCCTCCTAGCG
BAU              CTAAGTTCCTTTGGGTATATTAATACGACAACAATCTTATTGATATCCATTCTTCTAATT
SVI              GTACTAGACATATGATTATGAGTTCTTCTAACCTTTCTTTTTATTATTATTCTAGTGGGG
FOC              ATTAGTAATATTTTAGTACTAACCATACTAACATGATTTTTTATTTCAATTTTAATAATT
FGR_AP           TTTTCTAGCCAAACTCCTTTAATCCTACTCATATGCTTCTTTTTATTAATTTTGCTAATA
FGR_VL           TTTTCTAACCAAAGTTATTTAATTATTTTAATTACCTTTTTTATAATAATCCTTTTAATT
CTE              TCTAATAATGTTTTATCTTTAACGGCCCTAAGATTAATTTTTTTCTGAATTCTAATTATC
CAN              TTAAATAACACCATAGTAGTAATCAGAATGGCTTGTTTTTTTATATTTATTTTAATCACT
OOR              ATCTCTTCTTCTAATTCTTTAATTGTTTTGGCAACTTTTTTCCTAATCATCTTAATTTTG
OVI              CAAATTAAAATTATTTCAATCTCAATATTAACTCTATATTTCATTTTAATTCTAATTATA
TBI              TCTAAAACATTAATTAATATAATCACTCTTGGATCATTTTTTATTATCATTCTATTAATT
GHO              TTTATAAGACCAAATACATGGATTATATTAACTTTTATATTTTTAATGATTTTATTGGGA
                 ############################################################


                        310       320       330       340       350       360
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              GGATTATTTCATGAATGAAATGAAGGAGCTCTAGATTGGGACAAA---------------
PAQ              GGAGTGCTCCACGAGTGAACCCAAGGAGCTTTAAATTGAAGCATT---------------
BAU              GGTCTTTTATTTGAGTGAAATGAAGGTGCCTTAAAATGATTAAAT---------------
SVI              GGGACCATCCACGAATGGAAAGAAGGATCCCTCGACTGAACTAAATTTTGATGTAGAAAT
FOC              GGGCTATACCATGAATGAAATCAAGGAGCCTTAGAATGAGATAAA---------------
FGR_AP           GGCCTAGGACATGAATGAAAAGAAGGAGCGTTAAATTGATTAAAA---------------
FGR_VL           GGTCTTTTTTATGAATGAAAAGAAGGAGCTTTAAATTGATTAAAG---------------
CTE              GGGTTATACCATGAATGAAACCAAGGAGCCTTGGAATGAAAA------------------
CAN              GGCTTATATCATGAATGAAACCAAGGAGCTCTTGAATGAAAA------------------
OOR              GGCCTTTTCTATGAATGGAAAAACGGAGCTTTATATTGACCTAAA---------------
OVI              GGTTTATTTCATGAATGAAATGAAGGAGCTCTAGATTGAGATAAT---------------
TBI              GGTTTATACCACGAATGAAATCAAGGAGCACTATATTGACCTAAA---------------
GHO              GGACTTTTTCATGAATGAAATCAAGGAGCTCTTAATTGGTCTAAA---------------
                 #######################################                     


                        370       380       390       400       410       420
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ------------------------------------------------------------
PAQ              ------------------------------------------------------------
BAU              ------------------------------------------------------------
SVI              TACACTCCTGCTTCCCATAGCCATTATTTTCAACAAAACAAATATAACCTCATGAATCTC
FOC              ------------------------------------------------------------
FGR_AP           ------------------------------------------------------------
FGR_VL           ------------------------------------------------------------
CTE              ------------------------------------------------------------
CAN              ------------------------------------------------------------
OOR              ------------------------------------------------------------
OVI              ------------------------------------------------------------
TBI              ------------------------------------------------------------
GHO              ------------------------------------------------------------
                                                                             


                        430       440       450       460       470       480
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
OCI              ------------------------------------------------------------
PAQ              ------------------------------------------------------------
BAU              ------------------------------------------------------------
SVI              CGTAAGAGTACTATTCTTACTAGTGTTAATATTAGGCCTATTTCACGAATGAAATCAAGG
FOC              ------------------------------------------------------------
FGR_AP           ------------------------------------------------------------
FGR_VL           ------------------------------------------------------------
CTE              ------------------------------------------------------------
CAN              ------------------------------------------------------------
OOR              ------------------------------------------------------------
OVI              ------------------------------------------------------------
TBI              ------------------------------------------------------------
GHO              ------------------------------------------------------------
                                                                             


                        490
                 =========+========
OCI              ------------------
PAQ              ------------------
BAU              ------------------
SVI              AGCCCTCTCATGAGCAAG
FOC              ------------------
FGR_AP           ------------------
FGR_VL           ------------------
CTE              ------------------
CAN              ------------------
OOR              ------------------
OVI              ------------------
TBI              ------------------
GHO              ------------------
                                   






Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 7 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 11 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 4 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: None
Flank positions of the 1 selected block(s)
Flanks: [4  339]  

New number of positions in nad3.fas_checked.fasta.aligned.fastafasta:  336  (67% of the original 498 positions)