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1240 1250 1260 =========+=========+=========+=========+=========+=========+ OCI TGATTCCCATTATTTACAGGAAACAGCATAAATCCAGCATGACTGAAAATTCAGTTTATT PAQ TGATTCCCCCTTTTTACTGGGACTACAATAAACCCCACTTGATTAAAAACGCAATTCTTT BAU TGATTTCCATTATTTACAGGCCTATCTCTAAATGTCTCATGACTAAAATCTCATTTTATT SVI TGATTTCCTCTAATTACAGGATGTAGGATGAATCCATATTGACTAAATATTCAATTTGTT FOC TGATTCCCTTTATTCTCAGGAGTAAATTTAAATTCCAAGTGATTGAAAATTCAATTTTCA FGR_AP TGATTTCCATTATTTACAGGAACCTCAATAAATCCTTTATGATTAAAAACCCAATTTATT FGR_VL TGATTCCCTTTATTTACAGGAACCTCAATAAACCCATCTTGGCTAAAAAGTCAATTTTTA CTE TGATTCCCCTTATTCACAGGTGTGAATTTAAATCCTAAGTGGTTAAAAATTCAATTTTTT CAN TGGTTTCCTTTATTTACAGGGGTAAATCTAAATCCCAAATGACTTAAAATTCAATTTATA OOR TGGGCTCCATTATTTTTAGGCACATCAATAAATCCTTTTTGGCTAAAAATCCATTTTTTT OVI TGGTTCCCCTTATTCACAGGATGCAGTATAAATCCCTCTTGATTAAAAATTCAATTTATC TBI TGATTTCCACTATTCACAGGGTCTTCTATAAATCCTCAATGATTAAAAATTCAATTTTTT GHO TGATTCCCCTTATTTACAGGAGTTTCTTTAAATCCAAGATGATTAAAAACACAATTTATA ############################################################ 1270 1280 1290 1300 1310 1320 =========+=========+=========+=========+=========+=========+ OCI ATTATATTTATCGGAGTAAATATGACATTTTTCCCTCAGCATTTTTTAGGTTTAAACGGA PAQ ATGATATTTGTTGGTGTTAATTTAACTTTTTTCCCGCAACATTTTTTAGGGCTAAACGGT BAU CTCATGTTTATCGGAGTAAACCTGACTTTTTTCCCACAACACTTCCTAGGACTTAACGGA SVI ATCATGTTTATTGGGGTAAATATAACATTTTTTCCTCAACACTTCTTAGGTTTAAACGGG FOC ATTATATTTCTAGGAGTAAATTTAACATTTTTTCCACAGCATTTTCTAGGTTTAAATGGT FGR_AP ATAATATTTCTAGGTGTAAATATTACATTTTTTCCTCAACACTTTTTAGGGCTCAATGGA FGR_VL ATAATATTTATAGGGGTTAACTTAACTTTTTTCCCACAACATTTTCTAGGGCTTAATGGC CTE ACTATATTTATTGGTGTTAATTTAACCTTTTTCCCCCAACATTTTTTAGGATTAAATGGG CAN ACCATATTTATTGGGGTTAATATAACCTTTTTCCCCCAACATTTTTTAGGTTTAAACGGT OOR AGAATGTTTATTGGGGTTAATATAACCTTTTTCCCTCAACATTTTTTAGGAATAAACGGG OVI GTTATATTTATTGGTGTAAATATAACTTTTTTCCCTCAGCATTTTTTAGGATTAAATGGC TBI TCTATATTTATTGGAGTAAATATAGCCTTCTTTCCACAACATTTTCTAGGTATAAATGGA GHO GCTATATTTATTGGAGTAAATTTAACATTTTTTCCTCAACATTTCCTAGGGCTTAACGGT ############################################################ 1330 1340 1350 1360 1370 1380 =========+=========+=========+=========+=========+=========+ OCI ATGCCTCGTCGCTACTCTGACTACCCAGATGCTTTTACTTCATGAAATGTAGTATCTTCC PAQ ATGCCTCGGCGCTACTCTGATTACCCTGATTGCTTCAATGTGTGAAACTCCATCTCTTCC BAU ATGCCACGTCGATACTCAGACTACCCTGACTCCTTCACTTCTTGAAACATAATTTCTTCT SVI ATGCCCCGGCGATACTCAGACTACCCCGATGCTTACACATTCTGAAATGTTATTTCGTCT FOC ATACCCCGTCGCTATTCAGACTATCCAGATGCCTTTACATCATGAAACGTTGTATCTTCT FGR_AP ATACCACGTCGTTACTCTGATTATCCTGACTCCTTCTCGTCATGAAACTCTATCTCTACT FGR_VL ATACCCCGTCGTTACTCAGACTATCCTGATTCTTTTTCATCGTGAAACTCTATCTCTACT CTE ATACCTCGTCGATACTCAGACTACCCCGATGCTTACACCACATGAAATGTGATCTCTTCT CAN ATACCTCGTCGATACTCCGATTACCCAGATGCATACACCACATGAAATGTTGTATCCTCA OOR ATACCTCGTCGATACTCAGATTATCCAGATGCTTTCACTTTATGAAATATTATTTCCTCT OVI ATACCGCGACGATATTCAGACTACCCAGATGCTTTTACATCATGAAACGTTGTATCTTCT TBI ATACCACGACGGTACTCTGATTACCCAGATGCCTTCACTCTATGAAATATTATCTCATCT GHO ATACCACGACGATATTCTGATTACCCAGATGCTTTTTCAATATGAAATTCTGTTTCAACT ############################################################ 1390 1400 1410 1420 1430 1440 =========+=========+=========+=========+=========+=========+ OCI ATAGGAAGCTACACGTCTGTAGTAGCAATCTTACTATTCAGCCTAATTATTTGAGAAGCC PAQ ATTGGGAGAAACATCTCCTTAGTTGCAGTGTTATATTTTACATGAATCGTTTGAGAAGCC BAU TTAGGAAGCTATATTTCTCTTATATCTACATTTATCTTAATAGTAATCATTTGAGAAGCT SVI ATTGGAAGATATATCTCGGTAGCAGCAATCATTGTAATAAGATTTATTGTTTGACATGCC FOC ATGGGAAGATATACTTCATTAGTAGCAGTTCTAATCTTTAGTTTTATTATTTGAGAATCA FGR_AP ATAGGAAGATATATTTCATTAATAGCAATTATTTTGTTTATTTTTATTATTTGAGAAAGC FGR_VL ATAGGAAGTTATATCTCTCTTATGGCAGTTATCTTTTTTATTTATATTGTCTGAGAAAGA CTE TTAGGGAGATACACCTCTGTTGTAGCGGTATTAATATTTAGTTCCATTATTTGAGAGTCT CAN TTAGGAAGATACACATCTGTTGTGGCTGTCCTTATATTTAGATTTATTATTTGGGAGTCT OOR ATAGGAAGATACACATCTTTTATCGCGGTCCTTCTTTTTACCTTTATTTTATGAGAAGCT OVI ATGGGAAGATACGTCTCAGTTATTGCTATTTTAATTTTTAGTTTAATTATTTGAGAAGCA TBI ATAGGAAGATATACTTCTTTTATAGCCGTGTTATTTTTTAGATTTATTATATGAGAAGCT GHO ATAGGAAGCTATATTTCTCTTATAGCGGTAATTTTTTTTAGATACATTGTGTGAGAATCT 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GHO CATAACTACCCGCCATCAGACCATACTTACTCAGAACTTACGCTTATTAGATCTAATTAT ############################################# === OCI --- PAQ --- BAU --- SVI --- FOC --- FGR_AP --- FGR_VL --- CTE --- CAN --- OOR --- OVI --- TBI --- GHO CTA
Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 7 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 11 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 4 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: None
Flank positions of the 2 selected block(s) Flanks: [25 1011] [1015 1545] New number of positions in cox1.fas_checked.fasta.aligned.fastafasta: 1518 (97% of the original 1563 positions)